ارزیابی بیان RNA غیر کدکننده حلقوی hsa_circ_0043278 در کارسینوم کلیه و ارتباط آن با اطلاعات جمعیت شناختی و کلینیکوپاتولوژی بیماران

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 دانشیار، گروه ژنتیک پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
2 دکتری تخصصی، گروه ژنتیک پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
3 کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
4 کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
5 استادیار، گروه ژنتیک پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
6 دانشیار، گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
7 استادیار، گروه جراحی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
8 پزشک، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
9 استادیار، مرکز تحقیقات بیماری های غیرواگیر، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، ایران
چکیده
چکیده
مقدمه: کارسینوم سلول های کلیه( RCC) یکی از شایع ترین تومور های ادراری- تناسلی با مرگ و میر بالاست. شواهد فزاینده ای نشان می دهد RNA های غیر کدکننده حلقوی( circRNAs) بر پیشرفت بدخیم تومورهای مختلف تأثیر می‌گذارد. همچنین مطالعات پیشین، نقش و عملکرد circRNA های مختلف را در کارسینوم کلیه آشکار کرده اند. در این مطالعه نقش hsa_circ_0043278 در پیشرفت سرطان کلیه وپاتوژنز مرتبط با آن بررسی می شود.
روش کار: پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، میزان بیان hsa_circ_0043278 در نمونه های توموری کارسینوم کلیه در مقایسه با بافت نرمال مجاور تومور با استفاده از Real-time PCR ارزیابی شد. همچنین ارتباط بیان hsa_circ_0043278 با اطلاعات کلینیکوپاتولوژی و جمعیت شناختی بیماران بررسی شد.
یافته ها: نتایج مطالعات ما نشان داد که میزان بیان hsa_circ_0043278 در نمونه های توموری کارسینوم کلیه در مقایسه با بافت نرمال مجاور تومور، کاهش قابل توجهی دارد. علاوه بر آن تحلیل نتایج نشان داد که بیان hsa_circ_0043278 با سابقه ابتلا به بیماری کلیوی در بیماران مرتبط است به گونه ای که در افرادی که سابقه بیماری کلیوی داشتند، بیان این ژن پایین تر بود.
نتیجه گیری: hsa_circ_0043278 در سلول های توموری کارسینوم کلیه به طور قابل توجهی کاهش می یابد و با سابقه ابتلا به بیماری های کلیوی مرتبط است. بنابراین به نظر می رسد hsa_circ_0043278 با نقش سرکوب گری تومور در کارسینوم کلیه، در مسیر سیگنالینگ های مرتبط در ایجاد و پیشرفت تومور نقش به سزایی داشته باشد.
کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله English

Evaluation of the expression hsa_circ_0043278 in renal cell carcinoma and its association with demographic and clinicopathological information of patients

نویسندگان English

Yaser Mansoori 1
Zahra firoozi 2
Narges majdodin 3
Elham Mohammadisoleimani 4
Seyed Alireza Dastgheib 5
Ali Ghanbari Asad 6
Behnam mansoori 7
Shirin Tavanafar 8
Mohammad Mehdi Naghizadeh 9
1 Noncommunicable Diseases Research Center, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran ORCIDID: 0000-0002-9101-5552
2 PhD, Department of Medical Genetics, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran. ORCIDID: 0000-0002-8103-2244
3 MSc, Department of Medical Genetics, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran. ORCIDID:
4 MSc, Department of Medical Biotechnology, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran. ORCIDID: 0000-0002-3950-3102
5 MD. PhD, Department of Medical Genetics, School of Medicine, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran;
6 Noncommunicable Diseases Research Center, Fasa University of Sciences, Fasa, Iran.
7 Noncommunicable Diseases Research Center, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran
8 MD, Student Research Committee, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran.
9 PhD, Noncommunicable Diseases Research Center, Fasa University of Medical Sciences, Fasa, Iran. ORCIDID: 0000-0001-5562-103X
چکیده English

Abstract
Background and Objectives:
Renal cell carcinoma (RCC) is one of the most common urogenital tumors with high mortality. Increasing evidence suggests that circRNAs influence the malignant progression of various tumors. Previous studies have also revealed the role and function of various circRNAs in RCC. In this study, the role of hsa_circ_0043278 in renal cancer progression and its associated pathogenesis is investigated.
Materials and Methods:
After RNA extraction and cDNA synthesis, the expression level of hsa_circ_0043278 in RCC tumor samples was evaluated in comparison with normal adjacent tumor tissue using Real-time PCR. The association of hsa_circ_0043278 expression with clinicopathological and demographic information of patients was also investigated.
Results:
The results of our studies showed that the expression level of hsa_circ_0043278 in RCC tumor samples was significantly reduced compared to adjacent normal tissue. In addition, the analysis of the results showed that the expression of hsa_circ_0043278 was associated with a history of kidney disease in patients, such that in people with a history of kidney disease, the expression of this gene was lower.
Conclusion:
hsa_circ_0043278 is significantly reduced in RCC tumor cells and it is associated with a history of kidney disease. Therefore, it seems that hsa_circ_0043278, with its tumor suppressor role in renal carcinoma, plays a significant role in the signaling pathways involved in tumor development and progression.

کلیدواژه‌ها English

Renal cell carcinoma
hsa_circ_0043278
circRNAs
1. Bray F, Laversanne M, Sung H, Ferlay J, Siegel RL,
Soerjomataram I, et al. Global cancer statistics 2022:
GLOBOCAN estimates of incidence and mortality
worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer
J Clin. 2024;74(3):229-63.
2. Bray F, Ferlay J ,Soerjomataram I, Siegel RL, Torre
LA, Jemal A. Global cancer statistics 2018:
GLOBOCAN estimates of incidence and mortality
worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer
J Clin. 2018;68(6):394-424.
3. Goswami PR, Singh G, Patel T, Dave R. The WHO
2022 Classification of Renal Neoplasms (5th Edition):
Salient Updates. Cureus. 2024;16(4):e58470.
4. Alaghehbandan R, Siadat F, Trpkov K. What's new in
the WHO 2022 classification of kidney tumours?
Pathologica. 2022;115(1):8-22.
5. Leitão AL, Enguita FJ .A Structural View of miRNA
Biogenesis and Function. Noncoding RNA.
2022;8(1).
6. Annese T, Tamma R, De Giorgis M, Ribatti D.
microRNAs Biogenesis, Functions and Role in Tumor
Angiogenesis. Front Oncol. 2020;10:581007.
7. Anastasiadou E, Jacob LS, Slack FJ. Non-coding
RNA networks in cancer. Nat Rev Cancer.
2018;18(1):5-18.
8. Kristensen LS, Andersen MS, Stagsted LVW,
Ebbesen KK, Hansen TB, Kjems J. The biogenesis,
biology and characterization of circular RNAs. Nat
Rev Genet. 2019;20(11):675-91.
9. Yu T ,Wang Y, Fan Y, Fang N, Wang T, Xu T, et al.
CircRNAs in cancer metabolism: a review. J Hematol
Oncol. 2019;12(1):90.
10. Xu Y, Liu H, Zhang Y, Luo J, Li H, Lai C, et al.
piRNAs and circRNAs acting as diagnostic
biomarkers in clear cell renal cell carcinoma. Sci Rep.
2025;15(1):7774.
11. Zhang H, Liu L, Cui H, Yu L, Yue G. Research
Progress of CircRNAs Regulating Biological
Behavior of Clear Cell Renal Cell Carcinoma. Cancer
Research on Prevention and Treatment.
2021;48(8):814-9.
12. Mohammadisoleimani E ,Firoozi Z, Naghizadeh
MM, Asad AG, Jafari A, Pourjafarian MH, et al.
Expression analysis of hsa_circ_0020397,
hsa_circ_0005986, hsa_circ_0003028, and
hsa_circ_0006990 in renal cell carcinoma.
Experimental and Molecular Pathology.
2023;129:104848.
13. Wang J, Wang T, Hu S, Li J, Ni C, Ye M.
Hsa_circ_0043278 Inhibits Tumorigenesis and is
Downregulated in Colorectal Cancer. Cancer Manag
Res. 2021;13:965-75.
14. Barrett T, Wilhite SE, Ledoux P, Evangelista C, Kim
IF, Tomashevsky M, et al. NCBI GEO: archive for
functional genomics data sets--update. Nucleic Acids
Res. 2013;41(Database issue):D991-5.
15. Wu Y, Xie Z, Chen J, Chen J, Ni W, Ma Y, et al.
Circular RNA circTADA2A promotes osteosarcoma
progression and metastasis by sponging miR-203a-3p
and regulating CREB3 expression. Mol Cancer.
2019;18(1):73.
16. Shi Y, Liu C. Circular RNA hsa_circ_0043278
inhibits breast cancer progression via the miR-455-
3p/EI24 signalling pathway. BMC Cancer.
2021;21(1):1249.
17. Wang Y-D, Sun Z-L. Effects of miR-455 on PIK3R1
gene expression regulation and kidney cancer cell
functions. European Review for Medical &
Pharmacological Sciences. 2017;21(15).
18. Wang D, Zhang Y, Ren D, Meng C, Yang L.
Bioinformatics analysis illustrates the functions of miR-377-5p in cervical cancer .Biotechnology and
Genetic Engineering Reviews. 2024;40(4):4238-49.
19. Zhou Y, Li C, Wang Z, Tan S, Liu Y, Zhang H, et al.
CircRNAs as Novel Biomarkers and Therapeutic
Targets in Renal Cell Carcinoma. Front Mol Biosci.
2022;9:833079.
20. Zhou B, Zheng P ,Li Z, Li H, Wang X, Shi Z, et al.
CircPCNXL2 sponges miR-153 to promote the
proliferation and invasion of renal cancer cells
through upregulating ZEB2. Cell Cycle.
2018;17(23):2644-54.
21. He T, Zhang Q, Xu P, Tao W, Lin F, Liu R, et al.
Extracellular vesicle-circEHD2 promotes the
progression of renal cell carcinoma by activating
cancer-associated fibroblasts. Mol Cancer.
2023;22(1):117.
22. Jin J, Sun H, Shi C, Yang H, Wu Y, Li W, et al.
Circular RNA in renal diseases. J Cell Mol Med.
2020;24(12):6523-33.
23. Liu C, Han T, Shi Y. The decreased expression of
hsa_circ_0043278 and its relationship with
clinicopathological features of breast cancer. Gland
Surg. 2020;9(6):2044-53.
24. Zhang L, Zhang L, Zhang C, Shi S, Cao Z, Shao C,
et al. circTADA2A inhibited SLC38A1 expression and
suppresses melanoma progression through the
prevention of CNBP trans-activation. PLoS One.
2024;19(4):e0301356.
25. Wu Z, Zheng M, Zhang Y, Xie M, Tian S, Ding T, et
al. Hsa_circ_0043278 functions as competitive
endogenous RNA to enhance glioblastoma multiforme
progression by sponging miR-638. Aging (Albany
NY). 2020;12(21):21114-28.
26. Li N, Wu J, Hu B, Lu H, Gao J, Zhu L, et al.
Upregulation of hsa_circ_0000977 participates in
esophageal squamous cancer progression by sponging
miR-874-3p. J Clin Lab Anal. 2022;36(6):e24458.
27. Lu J, Kwan BC, Lai FM, Tam LS, Li EK, Chow KM,
et al. Glomerular and tubulointerstitial miR-638, miR-
198 and miR-146a expression in lupus nephritis.
Nephrology (Carlton). 2012;17(4):346-51.