:: دوره 20، شماره 2 - ( تابستان 1401 ) ::
جلد 20 شماره 2 صفحات 0-0 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی ژن های اختصاصی کارسینوم سلول کلیوی و تایید آزمایشگاهی بیان آن ها در رده سلولی ACHN در حضور توکسین seh باکتری استافیلوکوکوس اورئوس
Maryam Safarpour-Dehkordi ، Abbas Doosti* ، Mohammad-Saeid Jami
چکیده:   (499 مشاهده)
مقدمه: کارسینوم سلول کلیوی (RCC) شایع­ترین نوع سرطان کلیه در بزرگسالان است. هدف از مطالعه حاضر، دستیابی به ژن هایاختصاصی در RCC، بر­اساس مطالعات بیوانفورماتیک و ارزیابی تغییر بیان ژن­های شناسایی شده، در سلول­های ACHN پس از ترانسفکت ژن توکسین seh باکتری استافیلوکوکوس اورئوس، است.
روش کار: ابتدا همبستگی­های بیانی ژن­های دخیل در RCC در پایگاه داده TCGA مورد بررسی قرار گرفت و شبکه تعاملات ژن­ها ساخته شد. جهت تایید تعاملات ژنی شناسایی شده، مطالعات آزمایشگاهی در مدل سلولی ACHN انجام شد، به این صورت که ژن توکسین استافیلوکوکی seh در وکتور pcDNA3.1(+) کلون گردید و درون سلول­های ACHN ترانسفکت شد. پس از تایید عملکرد صحیح وکتور نوترکیب در این سلول­ها و القای آپوپتوز، بیان ژن­های کاندید به روش real time RT- PCR ارزیابی شد.
یافته­ها: همبستگی­های بیانی ژن­های دخیل در آپوپتوز توسط مطالعات in silico شناسایی شد و شبکه تعامل lncRNA-mRNA در RCC با موفقیت ایجاد شد. القای آپوپتوز تحت تاثیر بیان توکسین توسط فلوسیتومتری تایید شد. بیان ژن­های SOX9، SBF2/AS1، MAF و c-Maf در سلول­های دستورزی شده با وکتور نوترکیب نسبت به سلول­های شاهد، به صورت معناداری کاهش یافت. همچنین، افزایش بیان ژن­های LINC00671 و LINC02499 در سلول­های تراسنفکت شده با وکتور pcDNA3.1(+)-seh نسبت به گروه شاهد، مشاهده شد (p < 0.05) و این تغییر بیان تاییدی بر شناسایی دقیق ژن­های درگیر در آپوپتوز سلولی RCC بود.
نتیجه­گیری: نتایج بدست آمده نشان می­دهد که شبکه­های ژنی شناسایی شده در این مطالعه می­توانند چشم انداز جدیدی برای تحقیقات با هدف تعیین مسیر­های مولکولی جدید و درمان RCC فراهم کند.
 
واژه‌های کلیدی: کلمات کلیدی: کارسینوم سلول کلیه، آنالیز بیوانفورماتیک، توکسین SEH، رده سلولی ACHN
     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: سایر
دریافت: 1401/1/30 | ویرایش نهایی: 1401/3/30 | پذیرش: 1401/4/25

Research code: 162390788
Ethics code: IR.IAU.SHK.REC.1400.023


XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 20، شماره 2 - ( تابستان 1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها