:: دوره 19، شماره 1 - ( بهار 1400 ) ::
جلد 19 شماره 1 صفحات 34-43 برگشت به فهرست نسخه ها
تعیین ویژگیهای فیزیکوشیمیایی ناحیه Fc ایمونوگلوبولین G انسان به روش بیوانفورماتیک
سهیلا روهانی ، فاطمه حاجی قاسمی*
دانشگاه شاهد
چکیده:   (579 مشاهده)
مقدمه :ایمونوگلوبولینها] immunoglobulins (Igs) [ پاتوژنها را به طور اختصاصی شناسایی و منهدم می کنند. ایمونوگلوبولینG  IgG) ( فراوانترین Ig سرم بوده و نقش مهمی در دفاع علیه عوامل عفونی دارد. جزء دارای قابلیت کریستالیزاسیون] ([fragment of crystallizable (Fc) مولکولIgG، نقش اساسی در حذف عوامل بیگانه دارد. بررسی خصوصیات فیزیکوشیمیاییIgG Fc، درشناسایی بهتر اعمال آن و اهداف تشخیصی و درمانی سود مند است. بیوانفورماتیک حوزه علمی کارامدیست که از حجم عظیم اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر جهت حل مسائل زیستی استفاده می کند. هدف این پژوهش شناسایی ویژگیهای فیزیکوشیمیایی IgG Fc انسان با استفاده از بیوانفورماتیک میباشد.
روش کار: توالی و ساختار سوم IgG مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم آن با نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2) و ویژگی های فیزیکوشیمیایی (انعطاف پذیری، دسترسی سطحی و آب دوستی) بخش IgG Fc توسط مرورگرIEDB (Immune Epitope Database) تعیین گردیدند.
 یافته ها: در بخش IgG Fc انسان، مناطق دارای بیشترین دسترسی سطحی، آبدوستی و انعطاف پذیری در توالی حد فاصل اسید آمینه های شماره200-450 واقع شده اند. بعلاوه نواحی مذکور در توالی بین اسید های آمینه شماره 291-300 و 381-405 همپوشانی دارند که محتمل ترین مناطق قرارگیری اپیتوپها هستند.
نتیجه گیری: ویژگیهای فیزیکوشیمیایی IgG Fc انسان که در این مطالعه تعیین شدند درشناسایی هرچه بهتر اعمال IgG و پیشگویی اپیتوپهای ایمونوژن آن برای تولید آنتی بادیهای منوکلونال اختصاصی جهت تولید کیتهای تشخیصی، بهینه سازی کیتهای موجود و تولید پروتئینهای مشابه برای تشخیص و درمان و همچنین مطالعات فیلوژنتیکی سود مند هستند.
واژه‌های کلیدی: IgG انسان، بیوانفورماتیک، فیزیکوشیمیایی
متن کامل [PDF 1031 kb]   (135 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ایمنولوژی
دریافت: 1399/9/29 | ویرایش نهایی: 1400/3/10 | پذیرش: 1400/2/15

Research code: 524
Ethics code: IR.Shahed.REC.524



XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 19، شماره 1 - ( بهار 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها