|
شناسایی ژن های اختصاصی کارسینوم سلول کلیوی و تایید آزمایشگاهی بیان آن ها در رده سلولی ACHN در حضور توکسین seh باکتری استافیلوکوکوس اورئوس
|
Maryam Safarpour-Dehkordi  ، Abbas Doosti* ، Mohammad-Saeid Jami |
|
|
|
چکیده: (242 مشاهده) |
مقدمه: کارسینوم سلول کلیوی (RCC) شایعترین نوع سرطان کلیه در بزرگسالان است. هدف از مطالعه حاضر، دستیابی به ژن هایاختصاصی در RCC، براساس مطالعات بیوانفورماتیک و ارزیابی تغییر بیان ژنهای شناسایی شده، در سلولهای ACHN پس از ترانسفکت ژن توکسین seh باکتری استافیلوکوکوس اورئوس، است.
روش کار: ابتدا همبستگیهای بیانی ژنهای دخیل در RCC در پایگاه داده TCGA مورد بررسی قرار گرفت و شبکه تعاملات ژنها ساخته شد. جهت تایید تعاملات ژنی شناسایی شده، مطالعات آزمایشگاهی در مدل سلولی ACHN انجام شد، به این صورت که ژن توکسین استافیلوکوکی seh در وکتور pcDNA3.1(+) کلون گردید و درون سلولهای ACHN ترانسفکت شد. پس از تایید عملکرد صحیح وکتور نوترکیب در این سلولها و القای آپوپتوز، بیان ژنهای کاندید به روش real time RT- PCR ارزیابی شد.
یافتهها: همبستگیهای بیانی ژنهای دخیل در آپوپتوز توسط مطالعات in silico شناسایی شد و شبکه تعامل lncRNA-mRNA در RCC با موفقیت ایجاد شد. القای آپوپتوز تحت تاثیر بیان توکسین توسط فلوسیتومتری تایید شد. بیان ژنهای SOX9، SBF2/AS1، MAF و c-Maf در سلولهای دستورزی شده با وکتور نوترکیب نسبت به سلولهای شاهد، به صورت معناداری کاهش یافت. همچنین، افزایش بیان ژنهای LINC00671 و LINC02499 در سلولهای تراسنفکت شده با وکتور pcDNA3.1(+)-seh نسبت به گروه شاهد، مشاهده شد (p < 0.05) و این تغییر بیان تاییدی بر شناسایی دقیق ژنهای درگیر در آپوپتوز سلولی RCC بود.
نتیجهگیری: نتایج بدست آمده نشان میدهد که شبکههای ژنی شناسایی شده در این مطالعه میتوانند چشم انداز جدیدی برای تحقیقات با هدف تعیین مسیرهای مولکولی جدید و درمان RCC فراهم کند.
|
|
| واژه‌های کلیدی: کلمات کلیدی: کارسینوم سلول کلیه، آنالیز بیوانفورماتیک، توکسین SEH، رده سلولی ACHN |
|
|
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
سایر
دریافت: 1401/1/30 | ویرایش نهایی: 1401/3/30 | پذیرش: 1401/4/25
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
