دانشگاه علوم پزشکی جهرم مجله علوم پزشکی پارس 2717-0284 20 1 2022 05 22 Extracellular exosomes and preeclampsia: a microarray-based study and functional enrichment analysis اگزوزوم های خارج سلولی و پره اکلامپسی : یک مطالعه مبتنی برداده های ریز آرایه و تحلیل عملکرد 1 7 700515 10.22034/pjms.2022.700515 FA مهدی کریمی گروه نانوفناوری پزشکی، دانشکده فناوری های نوین پزشکی، مرکزتحقیقات سلولی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران 0000-0002-7977-3940 اباذر روستازاده گروه بیوشیمی و تغدیه، گروه علوم و فناوری های نوین پزشکی، مرکز تحقیقات بیماری های غیرواگیر، دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران 0000-0003-1021-7687 Journal Article 2022 12 25 Introduction: Preeclampsia (PE) is a heterogeneous pregnancy disease. The exact pathophysiology of PE is unknown.<br />Recently, exosomes have been indicated as a causative factor in the pathogenesis of PE. The aims of the study were to investigate microarray library data to extract the differentially expressed genes (DEGs) in PE and perform a functional enrichment analysis to predict the role of DEGs in the pathogenesis of PE.<br />Materials and Methods: GSE10588 microarray library data was analyzes by GEO2R and R package (version 4.1.0). Principal<br />component analysis (PCA) was performed to analyze the normality of the data. Annotation analysis was performed by Enrichr, DAVID 6.8 and PANTHER 16.<br />Results: Herein, microarray data analysis showed that LEP, OR8G2 and DST genes with log2 FC> 4 had a significant up-regulation , as well as PTCH1 and ZNF598 genes with log2 FC< -3 had a significant down-regulation in placenta of preeclamtic women. Cellular component analysis showed that most of the extracted genes in functional analysis were related to extracellular exosomes (EXEXs). In addition, the results showed that response to hypoxia, cell-cell adhesion, brain development and galactose metabolism were the enriched pathways.<br />Conclusion: Results of this study showed that EXEXs, response to hypoxia and galactose metabolism were significantly related to PE and could be used as prognostic factors for PE. مقدمه : پره اکلامپسی یک بیماری هتروژنوس در دوره بارداری است.  پاتوفیزیولوژی دقیق این بیماری مشخص نیست. امروزه اگزوزوم ها به عنوان یکی از عوامل دخیل در پاتوژنز این بیماری مطرح شده اند. اهداف مطالعه حاضر جستجوی کتابخانه های ریزآرایه و انجام تحلیل عملکرد روی ژن های استخراج شده برای پیش بینی نقش آن ها در پاتوژنز پره اکلامپسی بود.<br />روش کار: داده های ریز آرایه GSE10588 توسط GEO2R و نرم افزار R نسخه 4 تحلیل شدند. تجزیه و تحلیل اجزای اصلی ( Principal component analysis: PCA) برای بررسی نرمال بودن داده ها انجام شد. تحلیل عملکرد توسط DAVID 6.8 ، Enrichr  و  PANTHER 16 انجام گرفت.<br />یافته ها : تحلیل داده های ریز آرایه نشان داد که ژن های OR8G2 ، LEP و DST با میزان بیان Log2FC>4 ، افزایش معنادار و ژن های PTCH1 و ZNF598 با میزان بیان Log2FC<-3، کاهش معناداری در جفت زنان مبتلا به پره اکلامپسی دارند. تحلیل اجزای سلولی نشان داد که بیشترین تعداد ژن های استخراج شده در تحلیل عملکرد مرتبط با اگزوزوم خارج سلولی بوده و پاسخ به هیپوکسی، اتصال سلول به سلول، تکامل مغز و متابولیسم گالاکتوز نیز مسیرهای استخراج شده هستند.<br />نتیجه گیری : نتایج این مالعه نشان داد که اگزوزوم خارج سلولی، پاسخ به هیپوکسی و متابولیسم گالاکتوز به طور معناداری  با <br />پره اکلامپسی مرتبط بوده و می توانند به عنوان شاخص های پیش آگهی پره اکلامپسی به کار گرفته شوند. https://jmj.jums.ac.ir/article_700515_030e08cec1a95ff032849f9a0536d52e.pdf